Первым профессиональным клубом Эдуардо стал «Гремио». В его составе футболист дебютировал в 2007 году и в том же году выиграл чемпионат штата и дошёл до финала Кубка Либертадорес. В августе 2007-го Эдуардо перешёл в немецкий «Хоффенхайм», где и выступал до последнего времени. Играя на позиции атакующего полузащитника, бразилец провёл в составе команды 80 матчей и забил 18 голов.

В ноябре 2009 года новичок «Рубина» дебютировал в сборной Бразилии и на сегодняшний день провёл за неё 4 товарищеские игры. Эдуардо входил в расширенный список сборной на чемпионат мира в ЮАР, но в окончательную заявку не попал.